A vastagbéltükrözés szükségességének meghatározása minden esetben orvosi feladat.

A vastagbéltükrözést minden tisztázatlan eredetű hasi fájdalom, krónikus hasmenés, fogyás, emésztőrendszeri vérzés, hasmenés vagy székrekedés váltakozása esetén javasolt elvégezni.

Vérszékelés, jelentős fogyás, hányinger, hányás, tapintható hasi térfoglalás, széklet habitus változása alarm tünetként értékelendő, a kolonoszkópia elvégzése pedig kötelező.

Az 50. életév felett vastagbélrák szűrés céljából szintén javasolt az elvégzése. A negatív vizsgálat után tíz évig nyugodt lehet a beteg. Gyulladásos vastagbélbetegségben szenvedőknél (colitis ulcerosa, Crohn-betegség) a betegség kezdetétől számított 8-10 év után – a fokozott vastagbélrák kockázat miatt – 1-2 évenként indokolt a vizsgálat.

Örökletes vastagbél polyposis szindrómákban (pl.: Gardner-szindróma, familiáris polyposis szindróma, cancer family syndrome, Lynch-szindróma stb.) akár 10-12 éves kortól 1-2 évente is szükség lehet kolonoszkópia rendszeres elvégzésére.

Úgynevezett paraneopláziás (tumoros betegségekhez társuló) tünetek esetében (visszatérő trombózisok, vashiányos vérszegénység, dermatomyositis [a bőr és a vázizomzat gyulladásával, izomgyengeséggel járó tünetegyüttes]) a kivizsgálás részét képezi a vizsgálat.

Bizonyos májbetegségek esetén (primer sclerotizáló cholangitis, májban lévő térfoglalás) is indokolt a kolonoszkópia, továbbá akkor is, ha más képalkotó vizsgálattal a vastagbél betegségére utaló eltéréseket találnak.

Vastag- és végbélrák műtéti megoldását követően kötelező a rendszeres időközönként elvégzett vastagbéltükrözés. Speciális indikációt képez az ún. carcinophobia, azaz a ráktól való félelem. Ilyenkor a beteg megnyugtatása érdekében célszerű elvégezni a vizsgálatot.